Şəhər qəhrəmanlara ehtiyac duyur. Qaranlıq New York-u əsir almışdır. Shredder və onun yoldaşları bütün polis təşkilatını və politikacıları dəmir bir pəncə kimi əllərində tutmuşlar. Şəhər tamamilə ümidsiz vəziyyətdədir, ta ki kanalizasiyadan çıxan tamamilə adi olmayan dörd bacı – Ninja Tısbağaları – şəhrin yeni qəhrəmanları olmana qədər. Dəstə, qəddar reporter April O'Neal və onun çılğın kameramanı Vern Fenwick ilə birləşərək Shredder-in şeytani planlarına qarşı mübarizə verməlidir.