Sayborq olan gənc Alita kim olduğunu və ya haradan gəldiyini bilmədiyi bir vəziyyətdə, tanımadığı bir gələcəkdə oyanır. Mərhəmətli bir həkim olan İdo onu himayəsinə götürür və sayborq görünüşünün altında fövqəladə bir keçmişə sahib gənc bir qadının qəlbi və ruhu olduğunu fərq edir. Alita yeni həyatına alışmağa çalışarkən, həkim İdo da onu gizemli keçmişindən qorumağa çalışır. Yeni dostu Huqo isə Alitanın xatirələrini canlandırmasına kömək etmək istəyir. Bu vaxt şəhəri idarə edən təhlükəli və korrupsiyalaşmış qüvvələr Alitanın izinə düşür. Bənzərsiz döyüş bacarıqlarına sahib olduğunu kəşf edən Alita, keçmişi ilə bağlı bir ipucu əldə edir. Təhlükəli insanlarla üz-üzə qalan Alita, dostlarının, ailəsinin və dünyasının xilas edilməsində əsas rol oynayacaq.