Cəhənnəm alovları içində doğulan Hellboy, qəddar və dəli bir adam olan Qriqori Rasputin tərəfindən şər işlər görməsi üçün dünyaya göndərilmişdir. Axirətin müjdəçisi olan Hellboy, Professor Brumun rəhbərlik etdiyi Müttəfiq Qüvvələr tərəfindən xilas edilir. Professor Brum Hellboyun fövqəladə qabiliyyətlərini inkişaf etdirir və onu bir qəhrəman kimi yetişdirir. Qaranlıq keçmişinə baxmayaraq, Hellboy təəccüblü şəkildə xeyirxah birinə çevrilir və dünyanı təhdid edən şər qüvvələrlə mübarizə aparır. Rasputinin məqsədi isə Hellboyu yenidən qaranlıq tərəfə çəkmək və onun gücündən istifadə edərək dünya müharibəsi başlatmaqdır.